Como pesquisador em microbiologia, trabalhei com diferentes aspectos do metabolismo e organização celular das bactérias. Foquei meu trabalho em espécies diferentes de bactérias, algumas das quais são consideradas boas, como o ácido lácteo da bactéria que participa do processo de fermentação usado na produção de iogurtes ou queijos. Na Anses ou no Instituto Pasteur, trabalhei com bactérias patogênicas responsáveis por diferentes tipos de doenças em humanos e animais. Atualmente, coordeno o CIRM, uma rede de centros de recursos microbiológicos dedicados à conservação e à valorização de micro-organismos de importância ambiental, veterinária, biotecnológica e agronômica.